首先需要了解袋式過濾系統的過濾機理：液體從過濾袋內流向袋外，濾出的顆粒被截留在袋內，袋式過濾的工作原理是壓力過濾。袋式過濾系統主要包括三個部分：過濾容器、支撐網籃和過濾袋。

1、過濾袋材質的選擇：

首先按照所要過濾的流體化學名稱，依化學配合禁忌找出可用的濾材，再針對其過濾介質溫度，操作壓力，酸堿值，粘度（CPS），雜質類型如（硬顆粒，軟顆粒），雜質含量（PPM），操作條件(如，是否須要耐受蒸汽，熱水或化學品殺菌等)，逐一評估，并剔除不適用之濾材。用途也是一個重要的考慮因素，比方藥品、食品或化妝品用之濾材必須是FDA準許的材質；超純水則須挑選純凈、不含有釋出物會影響比阻抗的濾材；過濾氣體則須挑選疏水性材質以及是否需要"衛生級過濾"設計等等。

2、過濾袋的精度選擇：

這是一個令人困擾的問題。比如，要除去肉眼可見的顆粒，要選用20或25微米的過濾袋；要除去液體中云狀物，要選用1或5微米過濾袋；要濾除小的細菌則需0.2微米的過濾袋。問題在于有兩種過濾精度單位：精度／公稱精度。